醫(yī)療學(xué)即本教恰辛派“養(yǎng)生醫(yī)方”之說。《善緣項(xiàng)飾》說：“杰普赤席王子即辛饒由身化現(xiàn)之第二子，系揮薩杰美夫人于赤門杰席所生，受教于其父并發(fā)大心，掌握醫(yī)療術(shù)等苯教諸法，貫通二萬一千《療續(xù)》大典，成就醫(yī)藥本師不二者，審編《療方三十萬》等。”由此可知杰普赤席著述醫(yī)典宏揚(yáng)醫(yī)方明之大概。其中貫通二萬一千《療續(xù)》之意在《無垢光輝經(jīng)》中說：“審定《療方五部大續(xù)》，《九部大經(jīng)》，《八支秘訣》，《小支二萬一千》等，傳交杰普赤席王子及八大仙人掌管”。雖曾產(chǎn)生過如此眾多而深廣的醫(yī)典，但實(shí)際保存至今的只有《苯教甘珠爾》中的《甘露寶藏四本目》，即普措賽白杰波的伏藏《根本醫(yī)典藍(lán)本目》、《養(yǎng)生藥典白本目》、《療方花本目》、《治病黑本目》。此四本目乃《九部大經(jīng)》中的《四個(gè)本目》。著名的藏醫(yī)《四部醫(yī)典》（或《四續(xù)》亦根源于《療方五部大續(xù)》。由大譯師毗盧遮那譯自苯教之醫(yī)典。據(jù)尼瑪?shù)ぴ鏊陡手闋柧幠啃蜓浴罚端牟酷t(yī)典》中祈請(qǐng)仙人之名及醫(yī)療咒語均原封不動(dòng)地保持了象雄語，充分說明了其源自苯教醫(yī)典。此外，由三個(gè)印度瑜伽咒士從桑耶寺找到的伏藏本，亦應(yīng)是杰普赤席所說之《醫(yī)藥經(jīng)》及《七章本疏》等無疑。后期在藏流傳的醫(yī)療學(xué)源自古象雄文化之一明證是：敦煌古藏文文獻(xiàn)中，關(guān)于藥方有兩卷，火灸方兩卷，共四卷，其中一火灸方卷后記中說：“此卷在庫中亦無，乃從所有療方中搜集，并與象雄之根本療方相配而成。”

醫(yī)學(xué)在分析判斷某一病癥在病理上的遠(yuǎn)近諸種病因時(shí)，離不開卜算占卦，因此，在以五明之學(xué)分類時(shí)，這種卜算占卦之術(shù)便收類于醫(yī)方明之中。辛饒彌沃奇在為恰辛祖飛列加等人開示恰辛苯教之法時(shí)，亦將“度”（禳解）、療方、“求提”、占卜、圓光、占音、算學(xué)、醫(yī)藥學(xué)合融在一起，也鑒于此理。

藏醫(yī)最基本的典籍是《醫(yī)學(xué)四續(xù)》，即《本續(xù)》，《釋續(xù)》，《訣竅續(xù)》和《后續(xù)》。《賢者喜宴》載：“集一切秘訣之精華的《醫(yī)學(xué)四續(xù)》系由玉妥貢布所著，玉妥貢布乃真正的應(yīng)化身，匯集了藏地所有醫(yī)典訣竅之傳承，六度赴印”，又載“赤列法王云：（玉妥貢布）乃真正之殊勝化身。他住地之東面山上長滿各類藥草如香山，南面山上長滿熱性藥草，北面雪山上生長涼性藥草，西面有森林，尤如奇妙醫(yī)藥城（藥師佛凈土），他的心性法界為藥師佛，以各種思維為四部眷屬，著念為益列吉仙，本明之性為本明智慧仙而開示四續(xù)”。又載“有的認(rèn)為是藥師佛所說，有的認(rèn)為如同化身毗盧遮那開示瑜伽密續(xù)，于須彌山之顛一樣，乃為釋迦佛祖之化身示教，也有認(rèn)為是伏藏，有的認(rèn)為原有一小《本續(xù)》而由玉妥貢布作廣本，如此等等，不一而足。但以果證而論，此著者應(yīng)為化身佛，而以切脈、視尿診斷者，未見于其它醫(yī)方，乃世界醫(yī)學(xué)之殊勝者，尤其切合藏地之地理氣候，惠澤無量，是故頂禮如佛。”《知識(shí)總匯》載：“關(guān)于《四續(xù)》，有認(rèn)為是佛說與論典之任一者，有認(rèn)為佛說與論典兼而有之者，即使認(rèn)為是論典者，亦有眾多不同說法，但旦白寧奇法王師徒等認(rèn)為：外為佛說，內(nèi)為伏藏，秘為玉妥巴之作為佳。”《善說寶串》中說：適宜藏地地理氣候之《四續(xù)》，即由此化身佛所撰，如同玉妥巴在其《寧提》中所說，然而大多認(rèn)為是佛說，由扎巴恩息堅(jiān)掘藏而得。寧瑪巴之《十萬密續(xù)》中亦持此論。