完善科技創新的體制機制原因如下：

總體上經濟發展的技術含量仍然不高，重要產業對外技術依存度仍然較高，很多關鍵核心技術受制于人，戰略高技術領域科技力量薄弱；近年來科技投入大幅增長，組織實施了大批科技發展項目，但科技創新的質量和效率有待提高，目前我國科技人力資源總量位居世界第一，國際科學論文數量世界第二，全社會研究開發經費總額世界第四，發明專利授權量世界第四，但我國的科技成果整體水平不高，投入產出效率問題比較明顯；科技與經濟脫節問題依然嚴重，科技面向經濟、經濟發展依靠科技的局面尚未全面形成，眾多的科研成果只有很少部分轉化為現實生產力；企業創新的積極性仍然不高，企業創新動力和綜合競爭力明顯不足，國家出臺的各項鼓勵企業自主創新的財稅、金融、產業、政府采購等政策尚未真正落實到位，產學研結合的創新體制還未普遍形成，企業要成為技術創新的主體還有較大差距。