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由于棚戶區改造房屬于安置房的一種，根據相關政策規定，這類房產在五年內不能買賣。期滿，業主繳納相關稅費后，可申請辦理房產證，拿證后的房產和普通住房沒有差別，可正常買賣交易。棚戶區改造房的價格往往低于市場房價，算是福利性住房的一類，因此在買賣交易中，很少人會在未取得房產證的情況下，去購買這類房產，所存在風險實在太大，容易對自身利益造成影響。
棚戶區改造房很難確權，需要漫長的一段時間，可辦理房產證，但流程比較麻煩。因為它的性質、拿地的方式、產權的不同，所以不能按照同一種方法來處理。但可參照這些點來作出判斷，若能提供產權證，就可進行房產交易。但其中一部分的棚戶區改造房是小產權房，也就是使用集體土地來建造的，這類情況的房產，個人往往無法辦理過戶，因為產權屬于集體，只有房屋所有權屬于個人，所以這類性質的房產不能正常交易買賣。
