蛋白胨可作為碳源。蛋白胨是最佳的碳源，因為它的碳氮比和細菌的需求非常吻合。很多細菌的培養基都是以蛋白胨為碳源+氮源的，例如培養基因工程菌最為常用的LB培養基。

蛋白胨，英文名稱：peptone，是有機化合物。蛋白胨是將肉、酪素或明膠用酸或蛋白酶水解后干燥而成的外觀呈淡黃色的粉劑，具有肉香的特殊氣息。蛋白質經酸、堿或蛋白酶分解后也可形成蛋白胨。在胃內蛋白質的初步消化產物之一就是蛋白胨。蛋白胨富含有機氮化合物，也含有一些維生素和糖類。它可以作為微生物培養基的主要原料，在抗生素、醫藥工業、發酵工業、生化制品及微生物學科研等領域中的用量均很大，可以用來治療消化道疾病；不同的生物體需要特定的氨基酸和多肽，因此存在著各種蛋白胨，一般來說，用于蛋白胨生產的蛋白包括動物蛋白（酪蛋白、肉類）、植物蛋白（豆類）、微生物蛋白（酵母）等三種。能為微生物提供C源、N源、生長因子等營養物質。