來源不同:茯苓為多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核。而云苓為百合科植物光葉菝葜的干燥根莖。
性狀不同:市面上常見的茯苓為去皮后切制陰干或曬干的茯苓,呈立方塊狀或方塊狀厚片,白色、淡紅色或淡棕色,粉末為灰白色;云苓呈圓柱形,表面黃棕色或灰褐,凹凸不平,質堅硬。在菜市場常見刮了皮的新鮮云苓和刮皮切片的云苓片,在藥材市場或藥店、醫院藥房看到的是切片后干燥的云苓片,切面為類白色至淡紅棕色,折斷時有粉塵飛揚,以水濕潤后有粘滑感,粉末淡棕色。
口感不同:茯苓味淡,嚼之粘牙;云苓味微,甘澀且偏于味苦。
功效不同:茯苓性味甘淡平,入心、肺、脾、腎經。具利水滲濕,健脾,寧心之效,主用于水腫尿少,痰飲眩悸,脾虛食少,便溏泄瀉,心神不安,驚悸失眠;云苓性平味甘淡,入肝、胃經,有解毒,除濕,通利關節之效,主用于梅毒及汞中毒所致的肢體拘攣,筋骨疼痛;濕熱淋濁,癰腫,瘰疬,疥癬。