本質上的區(qū)別：微信商城本質上屬于一個手機的購物網(wǎng)站，只是應用很多微信公眾號里面的接口，如果不應用，微信商城可以通過手機瀏覽器單獨打開。微信小程序是微信上獨立的一個類似于APP的應用，無需下載，但必須依附于微信。

打開方式的區(qū)別：微信商城只能通過公眾號的底部菜單，才能進入微信商城；小程序既可以通過微信公眾號的底部菜單進入，也可在微信首頁的下拉直接進入。除此之外，小程序還可以通過搜一搜，附近的，好物圈等多達40多種方式打開小程序。

用戶體驗的區(qū)別：微信小程序更像是一個APP，所以在給用戶使用上，微信小程序更加流暢，快捷，用戶體驗感是好于微商城的。

微信官方審核的區(qū)別：先說微商城，您只需要有個營業(yè)執(zhí)照，有備案過的域名，就基本可以做微商城了。但如果您想做小程序，那必須要全部的資質，對于一些存在虛擬交易的，小程序在蘋果端是無法通過審核的。因為小程序在上架時，官方需要對您小程序本身和對應的資質進行審核。