毛霉菌分對人無害，毛霉常被應用于腐乳，毛豆腐等發酵工藝，可以產生蛋白酶、脂肪酶等酶系，賦予食物更好的風味和營養。毛霉菌感染的藥物治療應選擇兩性霉素B，若累及中樞神經系統或鼻竇，可考慮手術干預以降低病死率。毛霉的用途很廣，常出現在酒藥中，能糖化淀粉并能生成少量乙醇，產生蛋白酶，有分解大豆蛋白的能力，我國多用來做豆腐乳、豆豉。許多毛霉能產生草酸、乳酸、琥珀酸及甘油等，有的毛霉能產生脂肪酶、果膠酶、凝乳酶等。常用的毛霉主要有魯氏毛霉和總狀毛霉。腐生，廣泛分布于酒曲、植物殘體、腐敗有機物、動物糞便和土壤中。有重要工業應用，如利用其淀粉酶制曲、釀酒；利用其蛋白酶以釀制腐乳、豆豉等。代表種如總狀毛霉（M.racemosus）、高大毛霉（M.mucedo）、魯氏毛霉（M.rouxianus）等。